然而，如此多的企业进入青蒿素产业淘金导致了恶性竞争，到2007年年中，青蒿素价格已经从最红火时的每公斤8000元跌到了每公斤1350元，而生产青蒿素的成本大约在每公斤2000元左右。加之诺华这个占据中国青蒿素原料采购中六成左右份额的大客户只出了一张55.5吨的订单，国内大批制药企业生产线停工闲置，药厂、药农都抱怨叫苦。媒体称：“作为拥有自主知识产权的中国青蒿素产业，沦为跨国巨头的廉价打工仔。”中国最大的青蒿素原料生产企业重庆华立公司也宣布，2007年上半年该公司预计亏损约7000万元。
中国青蒿素企业试图通过产业协会的方式联合行动，让诺华多消化一点库存。2007年10月20日，第十一届生物医药产业发展论坛为“青蒿素产业”特设的封闭式圆桌会议举行了，华立科泰、上海复星、云南昆药等名企领头进行了与诺华的国际协商，但是没能够和诺华达成任何协议。瑞士诺华公司中国区总裁李振福在会上表示，诺华很难突破55.5吨的采购量，无法与国内企业就青蒿素库存积压问题达成有意义的新协议。
同时，李振福还表示，炒作15亿美元青蒿素市场与他们无关，2005年时诺华和世界卫生组织开始向中国政府和企业界宣传呼吁提高青蒿的种植和采收量是因为原料供应不足。他委屈地说：“我早就提醒中国企业不要盲目上青蒿素，诺华不应该为如今的青蒿素产业困局背负不应有的指责。”
12月，《华夏时报》爆出，有知情人士称，“商务部已经介入对诺华进行调查，此前多家企业向商务部反映，诺华对它们进行了误导，引发大面积种植青蒿，导致价格下跌。”据称，商务部进行了取证，当时诺华很紧张。对于“诺华口头承诺”的说法，商务部某人士表示，“任何一个企业，不管是签署协议还是进行口头承诺，起码要有企业公民社会责任感”。
目前，国家商务部正会同有关部门酝酿出台《青蒿素类产品出口秩序的管理办法》，从而规范我国青蒿素类产品的出口秩序，加强药品质量监管；同时，还将对青蒿素类产品，包括青蒿草、青蒿素及其衍生物原料药、衍生物药品制剂，实行出口许可证管理，促进青蒿素产业的健康发展。
由于诺华的青蒿素制剂占WHO采购量的近九成，而且作为复方制剂在非洲市场畅通无阻。但是中国青蒿素制剂企业多为单方制剂，由于抗药性已被市场拒绝，目前，华立等领头厂商刚刚在向复方制剂转型。因此，国内产业界和媒体怀疑诺华先是借在WHO采购目录中的统治地位抬高青蒿素价格，诱惑中国企业上马青蒿素，借此破除中国企业在原料产地和自主知识产权方面的竞争优势。如果商务部调查证明媒体猜测属实，诺华此举无疑是“扰乱中国产业”。
青蒿素事小，诺华“毁约”风波对其在中国产业界和政府心目中的形象更加不利。